الهدف من برنامج الماجستير في الهندسة البيئية هو تدريب الطلاب على قدرات تصميم وتنفيذ المشاريع في مختلف المجالات البيئية.
بالنظر إلى النمو السكاني المتزايد، والتنمية الصناعية وتعزيز رفاهية المجتمعات في جميع أنحاء العالم، كان تقييم الآثار البيئية لخطط التنمية دائمًا مصدر قلق رئيسي للحكومات في مختلف البلدان، حيث سلط الضوء على الحاجة إلى خريجي الهندسة البيئية من ذوي الخبرة والتعليم الجيد.
بعض المشاريع المتخصصة المتعلقة بهذا المجال تشمل:
•    تلوث المياه والتربة والهواء
•    تصميم محطات معالجة مياه الصرف الصحي
•    إدارة النفايات الحضرية والصناعية
•    نمذجة نقل الملوثات في الماء والتربة والهواء
يقوم قسم الهندسة الجيوتكنيكية بكلية الهندسة المدنية في جامعة أصفهان التقنية بقبول الطلاب بدرجة الماجستير منذ عام 1995.