يتضمن قسم هندسة المياه والمنشآت الهيدروليكية تصميم وتحليل وتحسين المنشآت المرتبطة بالمياه. هذا التخصص هو مزيج من تخصص الهندسة الإنشائية وتخصص هندسة المياه. عن طريق اختيار هذا التخصص، سيكون المهندس المدني قادرًا على تنفيذ المشاريع الإنشائية والهيدروليكية في وقت واحد. هناك رابط بين هذه الموضوعات الرئيسية وغيرها مثل الهندسة الجيوتكنيكية والهندسة البيئية وإدارة الموارد المائية. لهذا السبب يمكن لطلاب هذا القسم اختيار دروس اختيارية في الهندسة الجيوتكنيكية أو الإنشائية أو الزلازل أو المياه أو حتى الهندسة البيئية، مع التركيز على تصميم الهياكل المتعلقة بالمياه.